Мигратор - это одноразовое приложение.
Мигратор предназначен для разовой выгрузки каталога МойСклад в Битрикс24.
Мигратор переносит группы товаров, товары, услуги, комплекты и варианты товаров. Последние переносятся как отдельные товары.
При этом выгрузка каталога подразумевает отсутствие данных в каталоге Битрикс24. Приложение не анализирует текущий каталог товаров в Битрикс24.
Мигратор не является альтернативой нашему приложению по синхронизации данных. В случае запуска мигратора в Битрикс24, который синхронизируется с МоимСкладом нашим приложением, Вы получите дублирование структуры данных.